Phân tích
Bên cạnh tìm hiểu, cổng dữ liệu VinGen Data Portal còn cung cấp tính năng để lưu trữ và so sánh dữ liệu về các trường hợp, gene và biến thể. Phím Analysis nằm trên thanh công cụ phía trên bên phải cổng dữ liệu được dùng tạo ra những workflow để phát hiện những rỗi loạn gene.
Dịch vụ phân tích hiện đại cho phép người dùng phân tích những rối loạn gene của bộ dữ liệu họ tải lên hệ thống của chúng tôi. Người dùng thuận tiện làm theo những bước đơn giản sau để thực hiện phân tích cần thiết:
#
Chuẩn bị dữ liệuSau khi nhấn START, người dùng sẽ được chuyển đến trang chuẩn bị dữ liệu trong đó các bộ dữ liệu cần so sánh sẽ được tải lên theo những bước sau:
- Nhấp vào Bộ dữ liệu mới kích hoạt mẫu tải lên
- Điền tên tệp bạn muốn vào hộp Tên mẫu
- Tải tệp FASTQ đầu lên bằng cách nhấp chuột vào phím Browse ở trường tương ứng
- Tải tệp FASTQ thứ hai lên bằng cách nhấp chuột vào phím Browse ở trường tương ứng
- Tải tệp capture kit bằng cách nhấp chuột vào phím Browse ở trường tương ứng
- Nhấp chuột vào Analyze để chạy phân tích
#
Báo cáoVinGen Data Portal sẽ tự động phân tích bộ dữ liệu do người dùng tải lên. Sau khi phân tích hoàn thành, báo cáo gồm các chi tiết như ID, loại bộ dữ liệu, tổng kích cỡ, thời gian tải lên, thời gian QG, trạng thái QC sẽ hiển thị. Nếu trạng thái QC là "Pass", người dùng có thể xem báo cáo phân tích bằng cách nhấp chuột vào ID của phân tích muốn xem, và nhấp chuột vào Chi tiết. Sau đó, báo cáo chi tiết sẽ hiển thị như sau:
Người dùng có thể xem báo cáo tóm tắt dưới dạng các biểu đồ tròn của bộ dữ liệu mình tải lên cổng dữ liệu, hoặc tải báo cáo định dạng .tsv về máy tính bằng cách nhấp chuột vào đường dẫn ở trường download.